蛋白质质谱数据分析是指利用质谱技术对蛋白质进行分离、鉴定和定量分析的过程。质谱技术是一种基于质荷比（m/z）的分离和分析技术，通过测量离子化后蛋白质的质荷比和强度，可以获得蛋白质的分子量、序列信息、修饰状态和相对丰度等信息。

蛋白质质谱数据分析通常包括以下几个步骤：

1.样品准备：

将蛋白质样品进行酶解或化学裂解，将蛋白质分解成肽段。

2.肽段分离：

利用液相色谱（LC）等分离技术将肽段分离。

3.肽段离子化：

将分离后的肽段进行离子化，形成带电的离子。

4.质谱分析：

将离子化的肽段进行质谱分析，测量其质荷比和强度。

5.数据处理：

对质谱数据进行处理，包括峰识别、基线扣除、峰面积计算等。

6.蛋白质鉴定：

利用数据库搜索或谱图库匹配等方法，将质谱数据与已知的蛋白质序列进行比对，确定蛋白质的鉴定结果。

7.蛋白质定量：

利用质谱数据中的强度信息，对蛋白质进行定量分析，确定蛋白质的相对丰度或绝对浓度。

蛋白质质谱数据分析在生物医学、生物技术、药物研发等领域有广泛的应用，它可以帮助研究人员在药物发现的各个阶段进行有效的分析和筛选。以下是一些主要的应用领域：

1.药物靶点识别：

通过质谱分析，可以识别与疾病相关的蛋白质或蛋白质复合物，这些可以作为潜在的药物靶点。

2.药物筛选：

在高通量筛选（HTS）过程中，质谱技术可以用来快速分析大量化合物与靶蛋白的相互作用，从而筛选出具有潜在活性的化合物。

3.药物代谢研究：

质谱分析可以用来研究药物在体内的代谢途径，包括药物的吸收、分布、代谢和排泄（ADME）过程。

4.药物毒性评估：

通过分析药物在体内的代谢产物，可以评估药物的毒性和潜在副作用。

5.生物标志物发现：

质谱技术可以用来发现与疾病状态相关的生物标志物，这些标志物可以用于疾病的早期诊断、预后评估和治疗效果监测。

6.药物作用机制研究：

通过分析药物作用后的蛋白质表达变化，可以了解药物的作用机制和分子靶点。

7.药物开发过程中的质量控制：

在药物开发过程中，质谱分析可以用来确保药物纯度、鉴定药物结构、监测生产过程中的质量变化等。

8.个体化医疗：

质谱分析可以用来分析患者的基因组、蛋白质组和代谢组数据，从而为个体化医疗提供依据。

9.药物重定位：

通过分析已知药物的新作用靶点，可以探索药物在治疗其他疾病方面的潜力。

10.药物反应监测：

质谱分析可以用来监测患者对药物的响应，包括药物浓度、代谢产物和生物标志物的变化。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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